מערכת מג'נטו היא ללא ספק אחת מהמערכות הפופולריות ביותר בענף המכירות המקוונות וכיום מעל לשליש מבעלי החנויות בעולם הווירטואלי בוחרים לעבוד על בסיס מערכת זו , מספר כה רב של משתמשים אשר עושים שימוש עם מערכת מסוג זה מצביעים על היכולות והביטחון שיש לצרכנים העובדים מולה , מערכות קוד פתוח חולשות על מרבית האינטרנט והשימוש בהם הולך ומתרחב מאחר והן חוסכות בעלויות ומאחר והן מציעות לצרכן פתרונות מקיפים לכלל השימושים הרלוונטיים לפי טיב האתר והלקוחות כך ניתן לראות שמשתמשי וורדפרס עושים זאת לאתרים קטנים ובינוניים , משתמשי דרופל עושים זאת לביסוס של מערכות מעט כבדות יותר ומשתמשי מג'נטו נהנים משלל הכלים והשירותים העונים לצרכיי המכירות ברשת.
היתרונות של מג'נטו רבים כל כך שלא ניתן להזכיר את כולן גם אם נרצה בכך אבל במעבר מהיר על המערכת ובשימוש בו ניתן ללמוד על היכולות והיתרונות הרבים שיש למערכת זו על המתחרות בענף , מערכת מג'נטו פותחה במשך שנים רבות עם יעוד אחד בלבד – לשרת את ציבור המוכרים ברשת ולספק תהליך רכישה בטוחה ומהירה יחד עם מכלול אינסופי של תוספים ואפשרויות המשלימות כל צורך שיכול לעלות בכל שלב בחיי האתר , תוספים אילו הופכות את מערכת מג'נטו למפלצת חזקה שיכולה לעמוד בהתאמה למערכות חזקות ועוצמתיות כמו מערכות ניהול לקוחות ומערכות ניהול קופות בחנויות פיזיות לצד התממשקות עם חנויות וירטואליות באתרי הענק כגון איביי ואמאזון ולספק רשת שיווק ומכירה שמנוהל כולו במקום אחד.
החסרונות של מג'נטו נובעות בעיקר משלל האפשרויות האינסופי שיש למערכת זו להציע דבר שמבלבל רבים וגורם להם לאבד ידיים ורגליים אם כי ניתן די בקלות להתגבר על בעיה זו על ידי הגדרה של אפשרויות שאינם מוצגות בפאנל הניהול ואינם נגישות למנהלי האתר ובכך להסיר ממנו מעט מהקשיים עימם בעלי חנויות מסוג זה נאלצים לקבל , הגדרה של מערכת בסדר גודל כמו מג'נטו לא מתאימה עבור כל חנות מקוונת ובעלי אתרים שמוכרים מספר מצומצם של מוצרים יבחרו שלא לעבוד דרך מערכת מסורבל מעין זו אך חברות גדולות וארגונים עוצמתיים יבחרו להתמודד עם הקשיים ולנהל אתר רציני דווקא דרך מג'נטו.
המורכבות בפיתוח מג'נטו נמצאת בשלבי ההקמה של חנויות ממכר חדשות , כאשר מרכיבים עיצוב תבניתי ובוחרים לעשות בו שינויים כל מערכת העיצוב מתחילה לזייף וההתאמה למסכים מרובים כבר אינו פועל כמו שצריך הבעיה מתרחבת עוד יותר כאשר בוחרים להוסיף תוספים שפורצים את תבינת העיצוב כדוגמת תשלום בעמוד אחד בלבד או התממשקות עם מערכות חיצוניות לשליפה של נתונים וברגע שתבנית העיצוב מתפרקת המערכת כבר אינה מתפקדת כפי שנדרש והפגיעה מורגת בחווית המשתמש ולכן גם בחווית הרכישה באתר , מסיבות אילו חברות גדולות בוחרות לרוב לפתח עיצוב מותאם אישית עם ראיה לעתיד כך שכל אפשרות שהם בוחרים תראה טוב ותפעל כנדרש אך המחירים להתאמות אילו יקרות בהרבה מפיתוחים בסיסיים לאתרים ממערכות אחרות , לכן חשוב לבחור כמובן חברה המוסמכת על ידי מג'נטו העולמית (כיום יש רק 4 חברות מוסמכות בישראל) כך שתהיו רגועים לגבי התוצאות בסופו של תהליך ארוך ויקר במיוחד.
תוצאות ההשקעה במג'נטו מורגשות למשך שנים רבות ומספקות רווח אדיר לאילו שמשכילים לעבוד בצורה נכונה ולשדרג את המערכת בכל פעם שיוצא עדכון חדש מאחר ומערכת כמו מג'נטו הולכת ומתפרת כל הזמן והופכת ליותר ויותר משתלמת וידידותית ובמידה וביצעתם עיצוב ופיתוח על ידי חברה מוסמכת תוכלו להינות מהפירות גם שנים לאחר מכן (במידה והפיתוח יעשה בחובבניות כל עדכון יכול להיות פירצת אבטחה או לגרום לנזקים למערכת האתר) רבים מתלבטים האם ההשקעה הגדולה אכן שווה את המחיר ? התשובה לכך נמצאת בחברות הגדולות ביותר במשק העושות שימוש במג'נטו כבר מעל לעשור ובוחרות להמשיך ולעשות זאת גם בעתיד.
